Die Große Aue, ein über 80 Kilometer langer Nebenfluss der Weser, entspringt im Rödinghausener Ortsteil Dono. Im Gegensatz zu anderen Gewässern am Wiehengebirge verläuft sie von Süden nach Norden und durchquert das Gebirge. Seit 1989 wurde die stark begradigte Große Aue in einigen Abschnitten in ein neues, mäandrierendes Gewässerbett verlegt, um die Hochwasserrückhaltung zu verbessern. In den durch Wehre gesteuerten Hochwasserpoldern haben sich auetypische und bedrohte Arten angesiedelt, obwohl der naturferne Charakter des Baches erhalten blieb. Für den Abschnitt in Rödinghausen ist eine naturnahe Entwicklung des Bachverlaufs geplant. Der natürliche Überschwemmungsbereich, der dem Gewässer seinen Namen gab, soll teilweise wiederhergestellt werden, ebenso wie die Durchgängigkeit für wandernde Wasserlebewesen. Das Naturschutzgebiet „Auebachtal“ mit einer Fläche von knapp 15 Hektar wird von der Biologischen Station betreut. Durch Vertragsnaturschutz werden die artenreichen Wiesen extensiv genutzt, was späte Mahd und Verzicht auf Düngung umfasst.